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Abordagem baseada em MapReduce para a sequência comum mais longa em biosequências

by Jnaneshwar Bohara , Shashidhar Ram Joshi
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Book cover type: Paperback
  • ISBN13: 9786208499785
  • Binding: Paperback
  • Subject: N/A
  • Publisher: Edicoes Nosso Conhecimento
  • Publisher Imprint: Edicoes Nosso Conhecimento
  • Publication Date:
  • Pages: 52
  • Original Price: GBP 34.71
  • Language: Portuguese
  • Edition: N/A
  • Item Weight: 82 grams
  • BISAC Subject(s): General

A identifica��o da sequ�ncia comum mais longa (LCS) de sequ�ncias biol�gicas tem aplica��es significativas na bioinform�tica. Devido ao crescimento emergente das aplica��es bioinform�ticas, novas sequ�ncias biol�gicas com comprimentos maiores t�m sido utilizadas para processamento, tornando-se um grande desafio para os algoritmos LCS sequenciais. Poucos algoritmos LCS paralelos foram propostos, mas a sua efici�ncia e efic�cia n�o s�o satisfat�rias com o aumento da complexidade e do tamanho dos dados biol�gicos. Para superar as limita��es dos algoritmos LCS existentes e considerando o modelo de programa��o MapReduce como uma tecnologia promissora para computa��o paralela de alto desempenho e baixo custo, foi desenvolvido um algoritmo paralelo baseado em MapReduce para LCS. Esta abordagem adota os conceitos de tabelas sucessoras, pares de caracteres id�nticos, �rvore sucessora e travessia da �rvore sucessora para encontrar a sequ�ncia comum mais longa. A estrutura hadoop � utilizada para a realiza��o do modelo MapReduce.

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