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MapReduce-basierter Ansatz für die längste gemeinsame Teilsequenz in BioSequenzen

by Jnaneshwar Bohara , Shashidhar Ram Joshi
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Book cover type: Paperback
  • ISBN13: 9786208499372
  • Binding: Paperback
  • Subject: N/A
  • Publisher: Verlag Unser Wissen
  • Publisher Imprint: Verlag Unser Wissen
  • Publication Date:
  • Pages: 56
  • Original Price: GBP 34.71
  • Language: German
  • Edition: N/A
  • Item Weight: 87 grams
  • BISAC Subject(s): General

Die Identifizierung der l�ngsten gemeinsamen Teilsequenz (LCS) biologischer Sequenzen hat bedeutende Anwendungen in der Bioinformatik. Aufgrund des zunehmenden Wachstums von Bioinformatik-Anwendungen werden neue biologische Sequenzen mit gr� erer L�nge f�r die Verarbeitung verwendet, was eine gro e Herausforderung f�r sequenzielle LCS-Algorithmen darstellt. Es wurden zwar einige parallele LCS-Algorithmen vorgeschlagen, deren Effizienz und Effektivit�t sind jedoch angesichts der zunehmenden Komplexit�t und Gr� e biologischer Daten nicht zufriedenstellend. Um die Einschr�nkungen bestehender LCS-Algorithmen zu �berwinden und unter Ber�cksichtigung des MapReduce-Programmiermodells als vielversprechende Technologie f�r kosteng�nstiges, leistungsstarkes Parallelcomputing wurde ein MapReduce-basierter Parallelalgorithmus f�r LCS entwickelt. Dieser Ansatz nutzt die Konzepte von Nachfolgertabellen, identischen Zeichenpaaren, Nachfolgerb�umen und der Durchquerung von Nachfolgerb�umen, um die l�ngste gemeinsame Teilsequenz zu finden. Zur Realisierung des MapReduce-Modells wird das Hadoop-Framework verwendet.

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